Maple Leaf Canada

Irina Sadovskaya

Diplômes

2007 Habilitation à diriger des recherches (HDR) en Microbiologie-Biochimie
Contribution à l'étude du biofilm staphylococcique : approche chimique
soutenue à l'université du Littoral-Côte d'Opale (ULCO)

Version anglaise: part 1 [643K] part 2 [163K]. Version française: part 1 [780K] part 2 [167K].

1999 Thèse en biochimie
Contribution à l'étude de polysaccharides bactériens : les glucides de surface de Vibrio anguillarum, Vibrio ordalii serotype O:2 et Pseudomonas aeruginosa sérotype O5.
Soutenue à l'Université du Litoral-Côte d'Opale. Avis très favorable avec félicitations du jury
1983 Diplôme equivalent de DEA en Chimie, spécialisation: Chimie des composés naturels
Université d'Etat de Moscou
ULCO logo

Emplois

Langues

anglais, français (lu, parlé, écrit), italien (notions), russe (langue maternelle)

Activités de Recherche

Les glucides jouent un rôle primordial dans le fonctionnement des êtres vivants, et en particulier dans la vie des microorganismes. La caractérisation complète des produits glucidiques est indispensable pour la compréhension des phénomènes cellulaires et pour le développement des outils de traitement des infections et de diagnostic.

Ayant des bases fortes en chimie des composes naturels, j'ai acquis des connaissances des méthodes d'analyse des glucides complexes dans des laboratoires de renommée mondiale (laboratoire des polysaccharides des plantes de l'Institut de Chimie Organique, Académie des Sciences de l'URSS; puis Institut des Sciences Biologiques, Conseil National de Recherche a Ottawa, Canada).

Depuis mon arrivée à l'ULCO en 1998 j'ai mis en place une plate-forme expérimentale pour la préparation, la purification et l'analyse de divers polysaccharides. J'ai développé de nombreuses collaborations au niveau national et international.

Des résultats innovant ont été obtenus grâce à une collaboration avec Dr. E. Vinogradov (IBS, NRC Canada), spécialiste de renommée mondiale dans le domaine de la structure des glucides bactériens.

Collaborations scientifiques

Accueil des chercheurs

Participation à la direction des thèses

Publications

    Structure et potentiel des polysaccharides des algues
    Les macro- et microalgues sont connues comme étant une source de polysaccharides pourvus de propriétés biologiques prometteuses : anti-coagulants, anti-virales, anticancéreuses ou immunostimulantes digue de Wimereux, low tide
  1. Sadovskaya, I., Souissi, A., Souissi, S., Grard, T., Lencel, P., Greene, C. M., Duin, S., Dmitrenok, P. S., Chizhov, A. O., Shashkov, A. S., and Usov, A. I. (2014) Chemical structure and biological activity of a highly branched (1→3,1→6)-β-D-glucan from Isochrysis galbana. Carbohydr. Polym. 111, 139-48.
  2. Usov, A. I., and I. M. Dobkina. (1992). Polysaccharides of algae. 43. A neutral xylan and sulfated xylomannan from the red alga Liagora valida. Soviet J. Bioorg. Chem. 17:596-603.
  3. Usov, A. I., and I. M. Dobkina. (1989). Polysaccharides of algae 38. Polysaccharide composition of the red seaweed Liagora spp. and the structure of sulfated xylomannan. Bioorg. Khim. 14(5), 642-651.

    Polysaccharides de la paroi des bactéries lactiques
    Des bactériophages infectant les bactéries lactiques sont à l'origine de pertes économique importantes dans l'industrie laitière. De ce fait, la communauté scientifique porte un intérêt croissant à l'étude de la compréhension des mécanismes d'actions de lactophages. Notre travail a été effectué dans le cadre du projet ANR « Lacto-phage » (2011-2014, coordinateur- Prof. Christian Cambillau) qui avait pour but de mieux comprendre les interactions moléculaires spécifiques entre les lactophages et les structures glucidiques de la paroi (Cell Wall Polysaccharides, CW PS) de Lactococcus lactis.

    Nos collaborations avec Dr.M-P. Chapot-Chartier (Institut Micalis, Inra) et Prof.Douwe van Sinderen continuent avec succès.

    Lactococcus lactis

  4. Chapot-Chartier, M. P., E. Vinogradov, I. Sadovskaya, G. Andre, M. Y. Mistou, P. Trieu-Cuot, S. Furlan, E. Bidnenko, P. Courtin, C. Pechoux, P. Hols, Y. F. Dufrene, and S. Kulakauskas. (2010). Cell surface of Lactococcus lactis is covered by a protective polysaccharide pellicle.J. Biol. Chem. 285:10464-71.
  5. Ainsworth, S., Sadovskaya, I., Vinogradov, E., Courtin, P., Guerardel, Y., Mahony, J., Grard, T., Cambillau, C., Chapot-Chartier, M.P. and van Sinderen, D. (2014). Differences in lactococcal cell wall polysaccharide structure are major determining factors in bacteriophage sensitivity. MBio 5, e00880-00814.
  6. Bebeacua, C., Tremblay, D., Farenc, C., Chapot-Chartier, M.P.,Sadovskaya, I., van Heel, M., Veesler, D., Moineau, S. and Cambillau, C. (2013) Structure, Adsorption to Host, and Infection Mechanism of Virulent Lactococcal Phage p2. J Virol. 87, 12302-12312.
  7. Farenc, C., Spinelli, S., Vinogradov, E., Tremblay, D., Blangy, S., Sadovskaya, I, Moineau, S., Christian Cambillau, C. (2014). Molecular Insights on the Recognition of a Lactococcus lactis Cell Wall Pellicle by the Phage 1358 Receptor Binding Protein. J Virol 88 ,7005-7015

    Lactobacillus

  8. Vinogradov, E., Valence, F., Maes, E., Jebava, I., Chuat, V., Lortal, S., Grard, T., Guerardel, Y. and Sadovskaya, I. (2013) Structural studies of the cell wall polysaccharides from three strains of Lactobacillus helveticus with different autolytic properties: DPC4571, BROI, and LH1. Carbohydr Res 379, 7-12.
  9. Vinogradov, E., I. Sadovskaya, A. Cornelissen and D. van Sinderen (2015). Structural investigation of cell wall polysaccharides of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus 17. Carbohydr Res 413: 93-99.
  10. Cornelissen, A., Sadovskaya, I., Vinogradov, E., Blangy, S., Spinelli, S., Casey, E., Mahony, J., Noben, J-P., Dal Bello, F., Cambillau, C., van Sinderen, D. The baseplate of Lactobacillus delbrueckii bacteriophage Ld17 harbours a glycerophosphodiesterase J Biol Chem, Published on June 6, 2016 as Manuscript M116.728279

    Biofilm bactériens : composition, caractérisation structurale et rôle des composants glucidiques. Acides teichoiques, exopolysaccharides

    Le Biofilm bactérien peut être défini comme une communautés de bactéries enrobées dans une matrice extracellulaire (EC) qu'elles ont sécrété, adhérant à une surface inerte ou biologique. Les biofilms bactériens posent des problèmes importants dans le domaine de la santé publique, ainsi que dans les industries et l'environnement. Notre approche de l'étude de la composition des biofilms par des méthodes chimiques et physico-chimiques constitue une étape nécessaire pour le développement des outils de lutte contre les biofilms et offre des débouchés dans de nombreux domaines.

    Staphylococcus

    Le biofilm est considéré comme un facteur de virulence principal chez les staphylocoques à coagulase négative (CoNS), cause majeure des infections liées aux implants orthopédiques. L'étude des biofilms staphylococciques en vue de recherche des outils thérapeutiques de dépistage ou de traitement de ces infections nécessite une caractérisation approfondie de la composition chimique des substances polymériques EC. Cette thématique a été initiée par Prof. Said Jabbourii, anciennement Professeur à l'ULCO (1999-2008). Une série de nos travaux a contribué à une meilleure compréhension de la nature et la fonction des glucides dans le biofilm. Nous avons développé une collaboration avec le Prof. J. Kaplan, mondialement connu pour ses découvertes des outils enzymatiques anti-biofilm. Bénéficiaire de la bourse Fulbright pour la mobilité des chercheurs, Prof. Kaplan a passé 6 mois dans notre laboratoire en 2010.

  11. Jabbouri, S., and I. Sadovskaya (2010). Characteristics of the biofilm matrix and its role as a possible target for the detection and eradication of Staphylococcus epidermidis associated with medical implant infections.FEMS Immunol. Med. Microbiol. 59:280-91.
  12. Sadovskaya, I., E. Vinogradov, S. Flahaut, G. Kogan, and S. Jabbouri. (2005). Extracellular carbohydrate-containing polymers of a model biofilm-producing strain, Staphylococcus epidermidis RP62A. Infect. Immun. 73:3007-17.
  13. Sadovskaya, I., S. Faure, D. Watier, D. Leterme, A. Chokr, J. Girard, H. Migaud, and S. Jabbouri. (2007). Potential use of poly-N-acetyl-beta-(1,6)-glucosamine as an antigen for diagnosis of staphylococcal orthopedic-prosthesis-related infections. Clin. Vaccine Immunol. 14:1609-15.
  14. Chaignon, P., I. Sadovskaya, C. Ragunah, N. Ramasubbu, J. B. Kaplan, and S. Jabbouri. (2007). Susceptibility of staphylococcal biofilms to enzymatic treatments depends on their chemical composition. Appl. Microbiol. Biotechnol. 75:125-32.
  15. Sadovskaya, I., P. Chaignon, G. Kogan, A. Chokr, E. Vinogradov, and S. Jabbouri. (2006). Carbohydrate-containing components of biofilms produced in vitro by some staphylococcal strains related to orthopaedic prosthesis infections. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 47:75-82.
  16. Sadovskaya, I., E. Vinogradov, J. Li, and S. Jabbouri. (2004). Structural elucidation of the extracellular and cell-wall teichoic acids of Staphylococcus epidermidis RP62A, a reference biofilm-positive strain. Carbohydr. Res. 339:1467-73.
  17. Vinogradov, E., I. Sadovskaya, J. Li, and S. Jabbouri. (2006). Structural elucidation of the extracellular and cell-wall teichoic acids of Staphylococcus aureus MN8m, a biofilm forming strain. Carbohydr Res 341:738-43.
  18. Kogan, G., I. Sadovskaya, P. Chaignon, A. Chokr, and S. Jabbouri. (2006). Biofilms of clinical strains of Staphylococcus that do not contain polysaccharide intercellular adhesin. FEMS Microbiol Lett 255:11-6.
  19. Coulon, C., Sadovskaya, I., Lencel, P., Jabbouri, S., Kaplan, J.B. and Flahaut, S. (2012) Stress-induced dispersal of Staphylococcus epidermidis biofilm is due to compositional changes in its biofilm matrix. Adv. in Microbiol. 2, 518-522.
  20. Aarag Fredheim, E.G., Norbakken Granslo, H., Flægstad, T., Figenschau, Y., Rohde, H., Sadovskaya, I., Mollnes, I.E. and Klingenberg, C. (2011) Staphylococcus epidermidis Polysaccharide Intercellular Adhesin activates complement. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 63, 269-280.
  21. Stevens, N. T.,I. Sadovskaya, S. Jabbouri, T. Sattar, J. P. O'Gara, H. Humphreys, and C. M. Greene. (2009). Staphylococcus epidermidis polysaccharide intercellular adhesin induces IL-8 expression in human astrocytes via a mechanism involving TLR2. Cell Microbiol. 11:421-32.
  22. Kaplan, J.B., Jabbouri, S. and Sadovskaya, I. (2011) Extracellular DNA-dependent biofilm formation by Staphylococcus epidermidis RP62A in response to subminimal inhibitory concentrations of antibiotics. Res. Microbiol. 162, 535-541.
  23. Kaplan, J. B., LoVetri, K., Cardona, S. T., Madhyastha, S., Sadovskaya, I. Jabbouri, S. and Izano, E. A. (2012). Recombinant human DNase I decreases biofilm and increases antimicrobial susceptibility in staphylococci. The J. of Antibiotics 65, 73-77
  24. Wagstaff, J. L., I. Sadovskaya, E. Vinogradov, S. Jabbouri, and M. J. Howard. (2008). Poly-N-acetylglucosamine and poly(glycerol phosphate) teichoic acid acid identification from staphylococcal biofilm extracts using excitation sculptured TOCSY NMR. Mol. Biosyst. 4: 170-174.
  25. Wang, X., Sadovskaya, I., Leterme, D., Watier, D., Chokr, A., Zhu, Z. and Jabbouri, S. (2013) A comparative study of antibodies against proteins extracted from staphylococcal biofilm for the diagnosis of orthopedic prosthesis-related infections in an animal model and in humans. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 75, 124-129.
  26. Wang, X., Yao, X., Zhu, Z., Tang, T., Dai, K., Sadovskaya, I., Flahaut, S. and Jabbouri, S. (2009) Effect of berberine on Staphylococcus epidermidis biofilm formation. Intl. J. Antimicrob. Agents 34, 60-66.

    Aggregatibacter actinomycetemcomitans et Actinobacillus pleuropneumoniae

  27. Izano, E.A., Sadovskaya, I., Wang, H., Vinogradov, E., Ragunath, C., Ramasubbu, N., Jabbouri, S., Perry, M.B. and Kaplan, J.B. (2008) Poly-N-acetylglucosamine mediates biofilm formation and detergent resistance in Aggregatibacter actinomycetemcomitans Microbial Pathogenesis 44, 52-60.
  28. Izano, E.A., Sadovskaya, I., Vinogradov, E., Mulks, M.H., Velliyagounder, K., Ragunath, C., Kher, W.B., Ramasubbu, N., Jabbouri, S., Perry, M.B. and Kaplan, J.B. (2007) Poly-N- acetylglucosamine mediates biofilm formation and antibiotic resistance in Actinobacillus pleuropneumoniae. Microbial Pathog. 43, 1-9.

    Pseudomonas aeruginosa

    PEL in a test tube Pseudomonas aeruginosa est l'espèce bactérienne dont l'habitat est le plus vaste. P. aeruginosa peut être impliquée dans des infections communautaires et c'est l'une des bactéries les plus fréquemment isolées lors d'infections nosocomiales. C'est une bactérie pathogène opportuniste qui cause des infections irréversibles et mortelles chez les malades souffrant de mucoviscidose. Les infections chroniques se caractérisent par la formation du biofilm bactérien. Les polysaccharides extracellulaires (exopolysaccharides) et l'ADN extracellulaire (eDNA) sont considérés comme des composants clés dans la structuration du biofilm de P. aeruginosa.

    Le plus important est l'alginate, mais ce polysaccharide n'est produit que chez les souches dites mucoïdes. Chez la souche de référence P. aeruginosa PA14, souche non mucoïde, les molécules responsable de la rigidité de la pellicule ne sont pas clairement identifiés. Différents clusters de gènes sont impliqués dans la formation du biofilm ont été identifiés comme les loci psl et pel.

    Dans une série des travaux, nous avons identifié le produit glucidique du locus psl(Byrd et al., 2009). Nous avons identifié dans la matrice EC des souches non-mucoides un glucane β-(1,3) cyclique glycero-phosphorylé, capable de «piéger» les antibiotiques et codé par le locus ndv (Sadovskaya et al., 2010), et le LPS EC (Coulon et al., 2010). Il a été démontré, par la suite, que le locus pel est impliqué dans la biosynthèse d'un oligosaccharide chargé positivement se liant aux molécules de eDNA pour former une matrice rigide (Jennings et al., 2015).

    En collaboration avec le professeur Alain Filloux

  29. Sadovskaya, I. (2014) Chapter 29, Exopolysaccharide quantification, in Methods in Pseudomonas aeruginosa (Filloux, A., and Ramos, J. L., Eds.), Humana Press , pp. 347-357.
  30. Byrd, M. S., I. Sadovskaya, E. Vinogradov, H. Lu, A. B. Sprinkle, S. H. Richardson, L. Ma, B. Ralston, M. R. Parsek, E. M. Anderson, J. S. Lam, and D. J. Wozniak. (2009). Genetic and biochemical analyses of the Pseudomonas aeruginosa Psl exopolysaccharide reveal overlapping roles for polysaccharide synthesis enzymes in PSL and LPS production. Mol.Microbiol. 73, 622-638.
  31. Sadovskaya, I., E. Vinogradov, J. Li, A. Hachani, K. Kowalska, and A. Filloux. (2010). High- level antibiotic resistance in Pseudomonas aeruginosa biofilm: the ndvB gene is involved in the production of highly glycerol-phosphorylated beta-(1→3)-glucans, which bind aminoglycosides. Glycobiology 20, 895-904.
  32. Coulon, C., E. Vinogradov, A. Filloux, and I. Sadovskaya. (2010). Chemical analysis of cellular and extracellular carbohydrates of a biofilm-forming strain Pseudomonas aeruginosa PA14. PLoS ONE 5, e14220
  33. Jennings, L. K., K. M. Storek, H. E. Ledvina, C. Coulon, L. S. Marmont, I. Sadovskaya, P. R. Secor, B. S. Tseng, M. Scian, A. Filloux, D. J. Wozniak, P. L. Howell and M. R. Parsek (2015). Pel is a cationic exopolysaccharide that cross-links extracellular DNA in the Pseudomonas aeruginosa biofilm matrix. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 112, 11353-8.

    Vibrio cholerae

  34. Yildiz, F., Fong, J., Sadovskaya, I., Grard, T. and Vinogradov, E. (2013) Structural characterization of the extracellular polysaccharide from Vibrio cholerae O1 El-Tor. PLoS One 9, e86751.

    Listeria monocytogenes

  35. Combrouse, T., Sadovskaya, I., Faille, C., Kol, O., Guérardel, Y. and Midelet-Bourdin, G. (2013) Quantification of the extracellular matrix of the Listeria monocytogenes biofilms of different phylogenic lineages with optimization of culture conditions. J. Applied Microbiol. 114, 1120—1131.
  36. Brauge, T., I. Sadovskaya, C. Faille, T. Benezech, E. Maes, Y. Guerardel and G. Midelet- Bourdin (2016) Teichoic acid is the major polysaccharide present in the Listeria monocytogenes biofilm matrix. FEMS Microbiol Lett 363: fnv229.

    Etudes structurales des lipopolysaccharides (LPS) et des polysaccharides capsulaires (CPS) des bactéries Gram négatifs

    Pseudomonas aeruginosa
  37. Sadovskaya, I., J. R. Brisson, P. Thibault, J. C. Richards, J. S. Lam, and E. Altman. (2000). Structural characterization of the outer core and the O-chain linkage region of lipopolysaccharide from Pseudomonas aeruginosa serotype O5. Eur. J. Biochem. 267:1640-50.
  38. Sadovskaya, I., J. R. Brisson, J. S. Lam, J. C. Richards, and E. Altman. (1998). Structural elucidation of the lipopolysaccharide core regions of the wild-type strain PAO1 and O- chain-deficient mutant strains AK1401 and AK1012 from Pseudomonas aeruginosa serotype O5. Eur J Biochem 255:673-84.
  39. Masoud, H., I. Sadovskaya, T. de Kievit, E. Altman, J. C. Richards, and J. S. Lam.(1995). Structural elucidation of the lipopolysaccharide core region of the O-chain-deficient mutant strain A28 from Pseudomonas aeruginosa serotype 06 (International Antigenic Typing Scheme). J. Bacteriol. 177:6718-26.

    Vibrio spp.
  40. Sadovskaya, I., J. R. Brisson, N. H. Khieu, L. M. Mutharia, and E. Altman. (1998). Structural characterization of the lipopolysaccharide O-antigen and capsular polysaccharide of Vibrio ordalii serotype O:2. Eur. J. Biochem. 253:319-27.
  41. Sadovskaya, I., J. R. Brisson, E. Altman, and L. M. Mutharia. (1996). Structural studies of the lipopolysaccharide O-antigen and capsular polysaccharide of Vibrio anguillarum serotype O:2. Carbohydr. Res. 283:111-27.

    Pectinatus spp.
  42. Helander, I. M., A. Haikara, I. Sadovskaya, E. Vinogradov, and M. S. Salkinoja-Salonen. (2004). Lipopolysaccharides of anaerobic beer spoilage bacteria of the genus Pectinatus--lipopolysaccharides of a Gram-positive genus. FEMS Microbiol. Rev. 28:543-52.
  43. Vinogradov, E., J. Li, I. Sadovskaya, S. Jabbouri, and I. M. Helander.(2004). The structure of the carbohydrate backbone of the lipopolysaccharide of Pectinatus frisingensis strain VTT E-79104. Carbohydr. Res. 339:1637-42.
  44. Vinogradov, E., B. O. Petersen, I. Sadovskaya, S. Jabbouri, J. O. Duus, and I. M. Helander. (2003). Structure of the exceptionally large nonrepetitive carbohydrate backbone of the lipopolysaccharide of Pectinatus frisingensis strain VTT E-82164. Eur. J. Biochem. 270:3036-46.

    Polysaccharides des champignons
  45. Veignie, E., Vinogradov, E., Sadovskaya, I., Coulon, C. and Rafin, C. (2012) Preliminary characterization of a carbohydrate from the concentrated culture filtrate from Fusarium solani and its role in benzo[a]pyrene solubilization. Adv. in Microbiol. 2, 375-381.